发布时间：2014-12-31 13:19:34

RGB颜色对照表#FFFFFF#FFFFF0#FFFFE0#FFFF00#FFFAFA#FFFAF0#FFFACD#FFF8DC.........【阅读全文】

发布时间：2014-12-19 15:09:01

example <-read.table("1.txt")Warning message: In read.table("1.txt", header = F) : incomplete final line found by readTableHeader on '1.txt'上面是我的错误提示，咋回事呢，答案非常简单！打开1.txt文件，到文件最后一行，按Enter，让光标进入下一行，保存即可。Goto to the end of the last line of t.........【阅读全文】

发布时间：2014-12-17 10:35:24

前几天去南京参加两年一度的全国大会CCBSB2014，今年是第六届，见到许多熟识的前辈和老朋友，也结识了不少新朋友。相比于两年前在哈尔滨开的第五届大会，参会人数又多了100多。连大会特邀报告算上，总共76位学者做口头报告，其中30位学者我之前并不认识，这个比例正好是40%。领域里的大会小会，无论何时、何地，总有约40~.........【阅读全文】

发布时间：2014-12-12 13:09:32

find  /home/.. -name char* -o -name two*  ##在home下查找char开头的文件或者以two开头的文件find  /home/.. -name *.txt -ftype vfat    ##文件类型vfatfind  /home/.. -mtime -days_num    ##最近days_num改动过的文件find  /home/.. -mmin +50  .........【阅读全文】

发布时间：2014-12-05 10:54:03

####简单开始，此处已生物领域的动植物染色体为例##核心文件：   karyotype   = xx/xx.data     .........【阅读全文】

发布时间：2014-12-03 13:52:13

D:\>cpanIt looks like you don't have a C compiler and make utility installed. Trying to install dmake and the MinGW64 gcc compiler using the Perl Package Manageer.如果用ppm install Modulenames 也出错，中断，如何解决呢？这时我是找到circos基于的perl的文件夹里lib，放模块的地方，里面全是文件夹，然后.........【阅读全文】

发布时间：2014-11-23 17:22:22

地址：www.circos.ca核心文件：circos-x.tgz权限修改：chmod 777 file下载circos核心文件解压：tar -zxvf circos-.tgz基于perl的circos需要相关模块的安装： 首先，检查模块：cd circos-x.tgz -> cd bin -> ./test.modules  &  ./list.modules  ##注意，涉及权限的问题时，如果测试文件  &nb.........【阅读全文】

发布时间：2014-11-07 10:21:31

GFF格式是Sanger研究所定义，是一种简单的、方便的对于DNA、RNA以及蛋白质序列的特征进行描述的一种数据格式，比如序列的哪里到哪里是基因，已经成为序列注释的通用格式，比如基因组的基因预测，许多软件都支持输入或者输出GFF格式。目前格式定义的最新版本是版本3。GFF格式举例如下： 文件格式说明见下表：.........【阅读全文】

发布时间：2014-11-06 15:29:35

......【阅读全文】

发布时间：2014-11-06 15:26:42

安装ggplot2遇到的问题：> library(ggplot2)Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]) :   object 'vI' not foundError: ‘ggplot2’程辑包或名字空间载入失败解决的方案：我用的Rstudio，选择session，set working directory，我选择了D:\R\R-3.1.2，install.packages.........【阅读全文】

发布时间：2014-10-22 15:52:44

#!/usr/bin/perl -wprint"input your file,then press Enter!\n";my $file=<STDIN>;open FILE,"$file";open OUT,">result";  while (<FILE>){      chomp;      if(/>/){          $head=$_;      }else{$.........【阅读全文】

发布时间：2014-10-22 10:11:49

#!/usr/bin/perl -wprint"input seq_1,press Enter!\n";$seq_1=<STDIN>;open ONE,"$seq_1";print"input seq_2,press Enter!\n";$seq_2=<STDIN>;open TWO,"$seq_2";   while (<ONE>){       chomp;       if (/>/){      &nbs.........【阅读全文】

发布时间：2014-10-19 11:15:14

如果统计fastq序列的GC含量只需稍微改变一下即可！......【阅读全文】

发布时间：2014-10-14 12:43:17

windows：Copy *.txt  result.txt   ###首字母大写Linux： cat  *.txt  >result.txt    ### >输出符合带上......【阅读全文】

发布时间：2014-10-06 17:27:04

seq_microRNA = fasta read (' mir156.fa');n = length (seq_mircroRAN);   k = 1;for i = 1:n;k=k + 1;[A,B,D] = rnafold (seq_mirna (i), sequence);L = length (seq_mirna(i), sequence);AMFE = B/L;C = dimercount (seq_mirrna(i), sequence);GC = C.GC/(L-1);MFEI(i) = AMFE/GC;end......【阅读全文】