地址:
核心文件:circos-x.tgz
权限修改:chmod 777 file
下载circos核心文件解压:tar -zxvf circos-.tgz
基于perl的circos需要相关模块的安装:
首先,检查模块:cd circos-x.tgz -> cd bin -> ./test.modules & ./list.modules ##注意,涉及权限的问题时,如果测试文件 list.modules没有权限,而test.modules有权限,test.modules运行也报错,因为它调用了list.module,打开看下代码就知道了(细节)。
模块安装:安装cpan(yum install cpan),然后,perl -MCPAN -e shell 或者cpan,进入安装模式,然后install Modulename,ok!
主要的模块有:
Config::General
Font::TTF::Font(不行可以force install)
List::MoreUtils
Regexp::Common
Math::Round
Statistics::Basic
Set::IntSpan
Text::Format
Math::Bezier
Math::VecStat
Params::Validate
Readonly
SVG
Module::Build
YAML
Clone
GD
GD::Polyline
我个人觉得GD::Polyline和GD容易报错,因为需要libgd或者其他的绘图模块,libgd去单独下载,解压 ./configure,然后make。
最后测试:windows : perl bin\circos -conf example\etc\circos.conf
Linux : perl bin/circos -conf example/etc/circos.conf ##注意系统不同\ /的区别
其他后续补充:推荐华中农业大学棉花研究所相关资料
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