#!/usr/bin/perl -w
use strict;
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#
#使用方法:windows的dos界面或者linux下:perl file_name
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my ($input_file,$head,$line,$width,%seq);
print "输入文件名称,并按Enter\n";
$input_file=;
chomp$input_file;
open IN,"<$input_file";
open OUT,">result";
while (){
chomp;
if (/^>/){$head=$_;}else{$seq{$head}.=$_;}
}
print "程序负责单条序列转换成特定长度的序列\n";
print "输入期望的序列宽度,并按一下Enter键\n";
$width=;
chomp$width;
foreach $line(sort keys %seq){
chomp$line;
# $seq{$line}=~s/(?<=\w{30})(?
$seq{$line}=~s/((\w{$width})+?)(\w{0})/$1\n$3/gi; #折叠 这一块需要优化,最好的方法是用环顾(?=|?<=),比较一下就知道速度的差异了
print OUT "$line\n$seq{$line}\n";
}
exit;
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