Bioperl安装(win7/linux)

##########################   bioperl install    ##############################

win7 bioperl安装

用cpan安装

1）通过PPM安装MinGW（环境需要），输入cmd进入DOS界面，ppm install MinGW（ppm install MinGW64默认32位），事先需要安装activeperl或者strabberyperl。注意：需要考虑activeperl与MinGW兼容性（是否支持，版本问题）。

2）输入cpan进入一个 > 开头的CPAN shel界面，输入install CPAN更新一下，然后q退出，重新cpan进入。

3）输入o conf prefer_installer MB设定使用Build.PL安装，然后输入o conf commit保存一下。

4）接着就是install Module::Build | Test::Harness | Test::Most

5）下载  **.zip解压

6）cd进入文件夹，perl Build.PL   perl Build test   perl Build install

 

                           Linux bioperl安装

1）perl -MCPAN -e shell

2）install Bundle::CPAN | Module::Build

3）cpan>o conf prefer_installer MB

 cpan>o conf commit

 cpan>q

4）cpan>d /bioperl/

 选择一个安装

 cpan>install S/SE/SENDU/bioperl-1.5.2_100.tar.gz

 gunzip bioperl-1.5.2_100.tar.gz

 tar xvf bioperl-1.5.2_100.tar

 cd bioperl-1.5.2_100

5）perl Build.PL

   ./Build test

   ./Build install