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..微笑着看着杯中的花茶一片片撑开.. ..透明的花瓣里水破开的声音很轻微..

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Kristoffer  Knudsen,  Johannes  Waage 5 Dec 2013 翻译:斑斑 2016年7月14日 欢迎加入生物信息QQ群78750864讨论相关问题 1 Alternative 5’/3’ splice sites (A5 / A3) ?          可变转录起始位点(ATSS)/可.........【阅读全文】

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发布时间:2016-07-12 16:53:24

PAML 手册 By 斑斑 5 basemlg baseml相同的控制文件runmode= 0和basemlg可用的模型有F81,F84和gamma分布。变量given_rho,nhomo在这里无效。因为迭代过程中计算S.E.s总是会输出,因此 basemlg需要密集计算,因此对于数据分析推荐gamma模型。如果你选择使用baseml,然后在运行baseml将初始.........【阅读全文】

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发布时间:2016-07-12 16:19:10

By 斑斑 1 综述  DNA和蛋白质序列进行系统发育分析的软件包。  除了这个手册,请注意以下资源:  http: PAML FAQ页面://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/pamlFAQs.pdf PAML讨论组//www.rannala.org/phpBB2/,在这里你可以提交 PAML程序能做些什么PAML.........【阅读全文】

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发布时间:2016-07-04 20:04:27

本文翻译自CAP3自带的说明文档,由于水平有限,文中尚有存在疑义的地方,阅读时请参照原文进行解读。  TransDecoder识别转录本序列中候选的编码区域,诸如那些将RNA-Seq数据用Trinity从头组装或者使用Tophat和Cufflinks将RNA-Seq比对到基因组中构建的转录本。TransDecoder 基于以下标准识别可能的编码.........【阅读全文】

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发布时间:2016-06-30 17:53:29

本文翻译自CAP3自带的说明文档,由于水平有限,文中尚有存在疑义的地方,阅读时请参照原文进行解读。 若使用CAP3请引用文章:Huang, X. and Madan, A.  (1999)CAP3: A DNA Sequence Assembly Program,Genome Research, 9: 868-877. 简介我们在以下几方面对CAP序列组装程.........【阅读全文】

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