..微笑着看着杯中的花茶一片片撑开.. ..透明的花瓣里水破开的声音很轻微..
发布时间：2016-08-27 10:10:08
miRDeep是个老牌的从高通量数据中注释miRNA的程序。本文撰写时，其最新版本为2.0.0.8.更新时间为2016年的5月。本文记录一些在安装使用过程中遇到的问题，希望为遇到类似问题的朋友们提供一些启示和帮助。环境：系统：ubuntu 16.04 LTSPerl：5.22+问题1：install.pl 和 make_html.pl目前如果要使用miRDeep2，必须要运.........【阅读全文】
发布时间：2016-08-24 09:26:15
使用Infernal对Rfam 12进行RNA注释by 斑斑转载请注明出处，欢迎来QQ群178750864交流有关生物信息学的相关内容 Rfam库可以用于对RNA-Seq或宏基因组数据进行RNA类型的注释，在Rfam 11及其之前的版本，对未知序列的比对是基于rfam_scan.pl和Infernal 1.0.x来实现的，并且需要blast程序的辅助。Rfam_sca.........【阅读全文】
发布时间：2016-07-17 08:36:36
Kristoffer Knudsen, Johannes Waage 5 Dec 2013 翻译：斑斑 2016年7月14日 欢迎加入生物信息QQ群78750864讨论相关问题 1 Alternative 5’/3’ splice sites (A5 / A3) ? 可变转录起始位点（ATSS）/可.........【阅读全文】
发布时间：2016-07-12 16:53:24
PAML 手册 By 斑斑 5 basemlg baseml相同的控制文件runmode= 0和basemlg可用的模型有F81，F84和gamma分布。变量given_rho，nhomo在这里无效。因为迭代过程中计算S.E.s总是会输出，因此 basemlg需要密集计算，因此对于数据分析推荐gamma模型。如果你选择使用baseml，然后在运行baseml将初始.........【阅读全文】
