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2010-06-30 18:14:52
1.下载 bindgraph
解压缩文件
通过阅读README,配置需要的文件。
nice -20 ./bindgraph.pl --daemon --logfile /var/log/query.log
如果提示:Can't locate File/Tail.pm in @INC
解决方法:这是Perl语言发展史上
的一个里程碑。此后,广大自由软件爱好者开发了大量功能强大、构思精巧的Perl模块,极大地
扩展了Perl语言的功能。CPAN(Comprehensive Perl Archive Network)是internet上Perl模块
最大的集散地,包含了现今公布的几乎所有的perl模块。
几个主要的CPAN站点有:
国内:ftp://freesoft.cgi.gov.cn/pub/languages/perl/CPAN
国外:
我在这里介绍一下各种平台下perl模块的安装方法。以安装DBI模块为例。
1、Linux/Unix下的安装方法:
Linux/Unix下安装Perl模块有两种方法:手工安装和自动安装。第一种方法是从CPAN上下载
您需要的模块,手工编译、安装。第二种方法是联上internet,使用一个叫做CPAN的模块自动完
成下载、编译、安装的全过程。
a、手工安装的步骤:
从CPAN下载了DBI模块1.13版的压缩文件DBI-1.13.tar.gz,假设放在/usr/local/src/下。
cd /usr/local/src
解压缩这个文件:
tar xvzf DBI-1.13.tar.gz
这时会新建一个DBI-1.13的目录。
cd DBI-1.13
生成makefile:
perl Makefile.PL
建立模块
make
测试模块
make test
如果测试结果报告“all test ok”,您就可以放心地安装编译好的模块了。安装模块前,先要
确保您对perl5安装目录有可写权限(通常以su命令获得),执行:
make install
现在,写个程序试试吧。
#!/usr/bin/perl -w
use strict;
use DBI;
..
上述步骤适合于Linux/Unix下绝大多数的Perl模块。可能还有少数模块的安装方法略有差别,
所以最好先看看安装目录里的README或INSTALL。另外,上述过程是针对动态链接的Perl编译
器(所有Linux下预安装的Perl都是动态链接的),如果您在使用一个静态链接的Perl,您需要将
新的模块静态链接到perl编译器中,可能还需要重启机器。
b、使用CPAN模块自动安装:
安装前需要先联上线,并且您需要取得root权限。
perl -MCPAN -e shell
初次运行CPAN时需要做一些设置,如果您的机器是直接与internet相联(拨号上网、专线,etc.),
那么一路回车就行了,只需要在最后选一个离您最近的CPAN镜像站点。例如我选的是位于国内的
中国自由软件库ftp://freesoft.cgi.gov.cn/pub/languages/perl/CPAN 。否则,如果您的机器
位于防火墙之后,还需要设置ftp代理或http代理。
获得帮助
cpan>h
列出CPAN上所有模块的列表
cpan>m
安装模块
cpan>install DBI
自动完成DBI模块从下载到安装的全过程。
退出
cpan>q
2、Win32下的安装方法:
在Win32下,建议使用ActiveState的Perl for Win32,即ActivePerl。ActivePerl的主页在:
。在Win32下,最好也使用专门为ActivePerl定制的Perl模块。从
CPAN下载的Perl模块不能很好地在ActivePerl下使用。类似于CPAN模块,ActiveState也开发
了一个自动安装工具叫做PPM(Perl Package Manager)。
最通常的安装方法是:
首先联上线
在dos命令行下启动ppm
ppm
获得帮助
PPM>h
列出ActiveState站点上所有为Perl模块的清单。
PPM>search
安装模块
PPM>install DBI
自动完成DBI模块从下载到安装的全过程。
退出
PPM>q
如果您的机器位于防火墙之后,通过http代理上网,那么可以使用下面的方法。
对于老的基于perl 5.005的ActivePerl版本(ActivePerl 522以下版本,不包括ActivePerl 522),从
下载您需要的Perl模块,例如DBI.zip。
将其解压缩在C:\TEMP\DBI下
cd \TEMP\DBI
ppm install DBI.PPD
最新的基于perl 5.6的ActivePerl版本(ActivePerl 613及以上版本)的安装方法略有不同。安
装ActivePerl 613前需要先安装Microsoft的Windows Installer。
Windows Installer从这里下载:
ActivePerl 613从这里下载:
… ePerl-5.6.0.613.msi
对于基于perl 5.6的ActivePerl版本,从
PPMPackages/5.6/
下载您需要的Perl模块的安装描述文件,例如DBI.PPD
安装模块前需要先联上线
ppm install DBI.PPD。
If you are already familiar with installing CPAN modules, go-perl is no different from any other. If you aren’t, you may wish to experiment now.
Try typing the following:
perl -MCPAN -e shell
install GO::Parser
The following may also work:
cpan GO::Parser
If this is the first time using the CPAN installer, you will be asked a barrage of questions. You are best to answer with the defaults – you can always change this later.
If you do NOT have access to the system-wide perl directories on your system (these will typically be in /Library or /usr/local), then you should either get some help setting up CPAN for use with your system, OR you should follow an alternate protocol below. (You may wish to modify the value of PREFIX to ~ in the CPAN setup, as detailed in protocol III)
If you are on OS X you may need to do this:
sudo cpan GO::Parser
Providing you do have write-access to these directories, the above commands should hopefully go smoothly. When installing go-perl, you may be asked if you wish to also install Data::Stag and IO::String – you should answer yes
After this, you should be ready to use go-perl! The scripts should be in your path and the libraries should be in the standard place. You may wish to start by trying “map2slim” or “go2obo_xml”
There are certain applications that require additional third-party modules. All these are available from CPAN, and can be installed in the above manner. For example, if you try and use the go-filter-subset.pl script to generate a PNG image of an ontology subgraph, the system will complain you do not have the module “GraphViz” installed. To install this, simply type:
perl -MCPAN -e shell
install GraphViz
Depending on what you use go-perl for, you may not ever need to install other CPAN modules
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