发布时间：2016-03-28 17:38:51

这篇教程写了在不同工作模式下使用VIM的一些基本技巧 -- 即插入模式（insert mode）， 命令模式（command mode）， 存取文件等。目的是帮助刚刚接触VIM的新手更加有效率的使用这个出色的编辑器。说明：在这篇文章里面，代表Ctrl + X -- 就是按住Ctrl键然后再按X。而且你可以在很多情况下使用 :help command 来获得大.........【阅读全文】

发布时间：2016-03-28 17:36:56

全基因组重测序数据分析1. 简介(Introduction)通过高通量测序识别发现de novo的somatic和germ line 突变，结构变异-SNV，包括重排突变（deletioin, duplication 以及copy number variation）以及SNP的座位；针对重排突变和SNP的功能性进行综合分析；我们将分析基因功能（包括miRNA），重组率（Recombination）情.........【阅读全文】

发布时间：2016-03-28 17:33:18

    从原始的数据开始，进行reads回帖，到拼接转录本，计算表达量，分析差异表达，最后可视化分析结果。     TopHat是一个把reads回帖到基因组上的工具。首先用Bowtie把reads回帖到基因组上，然后通过拼接，我们就可以在基因组上看到一些reads堆叠起来的区域，称为consensus,这.........【阅读全文】

发布时间：2016-03-28 17:31:33

The output from short read aligners like Bowtie and BWA is commonly stored in SAM/BAM format. When presented with one of these files a common first task is to calculate the total number of alignments (reads) captured in the file. In this post I show some examples for finding the total number of re.........【阅读全文】