2006年开始台大对高性能计算机的硬件架构采取较开放的策略，由每个竞标厂商自行规划，在此时期共采购了1台IBM P595 Unix服务器与106台HP（惠普）DL140 G3的1U机架服务器。“如果你走到Unix服务器机柜后方就会觉得热，那你一定没走到机架式服务器后方，当你走到机架服务器机柜时会感觉到更热。”张杰生说。
散热不易是这台106机架式服务器所遇到最大的问题，由于密度过高再加上后方排线过多造成散热不易。当初IBM、Dell、升阳与HP的经销商都有投标，IBM与Dell的经销商提出刀片架构，而升阳与HP的经销商是以1U机架服务器来建置。
“价格是胜出的主因。”张杰生说，最后得标者为HP的机架式服务器。不过，当初负责的经销商也因为经营不善而结束经营，台大的后续维护变成难题。
张杰生表示，一个刀片模块就要14万元，而一台1U的机架式服务器却只要8万元，相同的价格可以买到更多的1U机架服务器，获得更多的运算资源，所以台大最后选择106台HP 1U服务器的方案。
张杰生说，HPC（High Performance Computing）运算负载量高，相对的服务器散发出的热量更高。张杰生表示，一般的1U服务器可能用在邮件、网站或档案服务器，这些应用的负载量不可能一直都达到满载，不过，在HPC的应用上却是有可能，因此1U机架式服务器所散发出的热量会比一般预期的还要高。
张杰生表示，以IBM刀片服务器与1U机架式服务器来比较，一台刀片可以容纳14组刀片模块，若将14个1U服务器叠在一起，相较于刀片服务器，机架式服务器散发出来的热量更胜一筹。
这套HP丛集计算机共建置4座机柜，而负责运算的106台机架式服务器则是安装在3个机柜中，平均每个机柜共容纳36台机架服务器，以42U的机柜而言，密度是相当高的。张杰生表示，相较于刀片服务器，机架式服务器由于无法解决散热的问题，系统的稳定度相当的低。「如果服务器一年只当机一次那还可以接受，但如果一个礼拜就有1～2台服务器发生不稳定，对于我们而言，就无法接受。」张杰生说。
排线是造成台大机架式服务器不稳定的一项主因。张杰生表示，一台机架式服务器后端就必须连结5～6条电线与讯号线，一个机柜容纳了30多台的服务器，后端排线便密密麻麻，不但造成整线的困扰，还因为排线过多，造成散热不易。
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