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2009-07-28 09:42:19

转载:

 XCrySDen 软件下载和安装说明

本帖最后由 zhanjie 于 2009-6-26 13:55 编辑

刚刚安装了XCrySDen 软件,本来一开始是想看vasp的结果的,但是不知道怎么看,yangjinrong_lon兄要是用过,不妨过来说说

这个软件的下载网址是里面有各种版本的,我安装的是xc-1.5.17-xc-1.5.17-linux_x86-semishared.tar.gz.tar.gz版本,我已经安装过,显示没有问题,安装过程比较简单,因为是tar文件所以不用安装,只需要设置一些环境变量即可。

(12.9 MB)

下面是安装过程:

1.首先解压缩tar文件 tar zxvf xc-1.5.17-xc-1.5.17-linux_x86-semishared.tar.gz.tar.gz

2. 进入XCrySDen-1.5.17-bin-semishared文件夹,执行./xcConfigure.sh 然后会问你一些问题,你只要简单的选择Y和N就行了。

3. 设置环境变量 vi .bashrc
XCRYSDEN_TOPDIR=/public/all/XCrySDen-1.5.17-bin-shared
XCRYSDEN_SCRATCH=/tmp/XCRYSDEN_SCRATCH
export XCRYSDEN_TOPDIR XCRYSDEN_SCRATCH
PATH="$XCRYSDEN_TOPDIR:$PATH:$XCRYSDEN_TOPDIR/scripts:$XCRYSDEN_TOPDIR/util"

4.保存bashrc 文件
  source .bashrc

5.运行,只需输入xcrysden即可 ,linux系统需要x显示软件,比如xwin,exceed,Xmanager等等

6.在配置过程中,会告诉你要实现一些功能需要哪些额外的软件,下面是地址,有兴趣的可以去下载
XCRYSDEN uses a few external utility programs. These are the following:
   1.) the "Open Babel" program is needed to display molecular structure from
       Gaussian Z-matrix file.
   2.) the ImageMagick's suit of programs is used to print-to-file (PNG/JPG/GIF/...),
       to create animated-GIFs, and to screen dump windows.
   3.) the "Mplayer's mencoder" program is used to create AVI/MPEG movies
       from the animation snapshots.
   4.) xcrysden may also use other programs such as gifsicle, xwd, ppmtompeg, ...
   Open BABEL:  
   IMAGEMAGICK: http://www.imagemagick.org/
   MENCODER:   

显示效果


7.功能简单介绍,下面是转载量子化学网的描述  

简介  
  显示晶体和分子的结构和电子密度程序。它还可以处理倒格子空间的特性,如绘制能带结构图,显示Fermi面,等。
功能  
晶体和分子的特性分析(如,原子上的力)
显示分子模型(线图,棒图,球棍模型,曲面模型......;转动,平移,放大......)
测量模型的键长,键角和二面角
显示晶体的Wigner-Seitz晶胞和布里渊区
读取标准格式的分子结构文件:XYZ,PDB,XSF
制作动画
提供晶体从头计算程序CRYSTAL的图形用户界面
晶体从头计算程序WIEN的晶体结构可视化,产生二维/三维电子密度,生成用于键结构图的k-网格
显示从头计算程序GAUSSIAN,CRYSTAL,PWSCF,WIEN,FHI98MD计算的结构

XCrySDen 1.6的新功能:
1. 兼容Quantum-Espresso 4.x,WIEN2k_08,和CRYSTAL06。
2. 支持几种电影编码器。
3. 改善了测量过程,选择原子更容易。
4. 实时获取显示图像,存为电影。
5. 鼠标滚轮支持缩放显示。
6. 简化了安装过程。
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