MPICH 2

配置mpich2运行环境



  
前段时间帮同学在linux下配了一个集群环境，参考了一些网上的文章，就把过程写出来，做个参考吧。
其实在我们的环境下ssh已经是配置好的，但是我还是把网上看到的写下来，而且这个配置过程我试过，没有什么问题。
创建SSH信任连接
1、更改/etc/hosts文件
　　
　　vim /etc/hosts
　　编辑为下面内容：
　　127.0.0.1 localhost.localdomain localhost
　　192.168.110.172 scc-m　　#node01的IP
　　192.168.110.172 node01　　#node01的IP
　　192.168.110.173 node02　　#node02的IP

2、在node01生成SSH秘钥对
　　
　　ssh-keygen -t rsa
　　产生.ssh目录
　　
　　ls -a
　　查看确认无误
3、生成authorized_keys文件

　　cd .ssh
　　进入.ssh目录

　　cp id_rsa.pub authorized_keys

4、建立本身的信任连接

　　cd ..
　　退出到/root目录下
　　
　　ssh node01
　　按提示输入yes

5、设置node02
　　ssh-keygen -t rsa
　　生成.ssh目录

　　scp 192.168.110.172：/root/.ssh/* /root/.ssh
　　拷贝node01上的.ssh文件夹到本地并覆盖本地的该目录

　　scp 192.168.110.172：/etc/hosts /etc/hosts
　　拷贝node01上的hosts文件覆盖本地的hosts

　　ssh node01
　　提示处输入yes

6、确认两台机器的信任连接已建立

　　在每个节点试验执行：
　　ssh node01
　　ssh node02
　　如果有提示，在提示处输入yes回车，只要确定无需输入密码就能登陆即可
下面是安装mpich2的过程
二、安装MPICH2

1、到MPICH官方网站下载源代码包，解压缩

　　tar -zxvf mpich2-1.0.7.tar.gz
　　
2、创建安装目录

　　mkdir /usr/MPICH-instsll

3、进入mpich2解压到的目录里

　　cd mpich2-1.0.7

4、下面就是编译安装软件的那三个基本步骤——检查配置、编译、安装，这次在./configure后还设置了安装目录

　　./configure --prefix=/usr/MPICH-install

5、修改环境变量(编辑.bashrc文件)

　　vim .bashrc
　　
　　修改环境变量为（新增PATH一行）：
　　
　　# .bashrc
　　# User specific aliases and functions
　　PATH="$PATH:/usr/MPICH-install/bin"  #这个地方用自己的安装路径，我们是以普通用户的权限来安装的，所以路径不是这样。
　　alias rm='rm -i'
　　alias cp='cp -i'
　　alias mv='mv -i'
　　# Source global definitions
　　if [ -f /etc/bashrc ]; then
　　        . /etc/bashrc
　　fi

6、测试环境变量设置，下面是我测试成功的屏显：

　　[user@node01 ~]$ which mpd
　　[user@node01 ~]$ which mpicc
　　[user@node01 ~]$ which mpiexec
　　[user@node01 ~]$ which mpirun

7、修改/etc/mpd.conf文件，内容为secretword=myword

　　vim /etc/mpd.conf                 # 自己创建，并写入secretword=myword保存，由于我们没有root权限，所以我改在主目录下建立.mpd.conf文件并写入内容

　　设置文件读取权限和修改时间戳

　　chmod 600 /etc/mpd.conf
　　touch /etc/mpd.conf               # touch .mpd.conf，写入之后这一步可以省略

8、创建主机名称集合文件/root/mpd.hosts   # 同样我们在主目录下创建该文件并写入内容

　　vim mpd.hosts
　　文件内容如下：
　　node01
　　node02
三、测试

1、本地测试

　　启动：
　　mpd &
　　
　　观看启动机器：
　　mpdtrace

　　退出：
　　mpdallexit

2、运行集群系统

　　mpdboot -n 2 -f mpd.hosts
　　参数-n 2指定了要起动的机器个数，-f mpd.hosts指定了通过mpd.hosts运行

　　mpdtrace

　　mpdallexit

3、测试运行MPICH的程序

　　mpdboot -n 2 -f mpd.hosts
　　启动这两台机器

　　mpiexec -n num /example/hello
　　用num指定使用的进程数

　　mpdallexit

四、查错

1、通过mpdcheck获得帮助信息

　　mpdcheck -pc

2、查错

　　mpdcheck -l

3、通过mpd.hosts文件查错

　　mpdcheck -f mpd.hosts
　　如果无错误

　　mpdcheck -f mpd.hosts  -ssh

4、对任意两台机器进行查错

　　node01上：

　　mpdcheck -s
　　返回主机名host和端口port
　　
　　node02上：

　　mpdcheck -c host port

5、mpd查错

　　node01上:
　　
　　mpd -e &
　　返回使用的端口

　　node02上:

　　mpd -h m1 -p echoed_port_m1 &