北鲲云超算平台如何加速生命科学研究

提到北鲲云，许多业内同僚首先想到的是，这是一家为有提供高性能算力SAAS服务及整合企业线下及云上资源，提供安全、弹性、自主的企业级Cloud-HPC方案的云计算公司。随着云计算基础设施和技术的成熟，诸如生命科学、人工智能、芯片设计、工业仿真、大气海洋等行业对于云计算的需求快速增长。北鲲云正是基于这样的市场需求自主研发了北鲲云超算平台，今天我们以生命科学行业为例，具体看看北鲲云超算平台是如何加速生命科学研究的。


众所周知，高性能计算在生命科学领域中的应用是近几年才出现的，而且主要应用在基因测序、分子动力学模拟，以及虚拟筛选等流程。简单来说就是通过实验仪器对生物分子进行测量，然后使用一些后处理软件对原始的大量数据进行处理和分析，接着对序列数据进行同源及相似性搜寻、比对、序列分析、遗传发育分析等。而分子动力学模拟则是对于原子和电子所构成的多体系统，用计算机模拟原子核的运动过程，从而计算这个多体系统的结构和性质。虚拟筛选是根据模拟小分子配体与生物大分子受体的相互作用，预测两者间的结合模式和亲和力，从而进行药物的虚拟筛选。


药物的虚拟筛选是依靠其所收集的基因测序的数据以及生物分子结构的数据库为基础，首先通过X射线-单晶衍射等技术获得受体大分子结合部位的结构，然后通过数据库搜寻或者全新药物分子设计技术识别得到分子形状和理化性质与受体作用相匹配的分子。简单来说，有些类似与AI建模。对于人工智能系统来说，其所建立的参数规模越大，往往就越聪明。药物的虚拟筛选也是一样，当其数据库中，所收集的生物分子信息与基因序列越多，其所能产生先导化合物的可能性就越大。因此，效率也就越高。
然而，对于生命科学而言，基因测序与分子动力模拟所产生的数据量巨大，要建立如此大的模型算力成本自然十分高昂，很大程度上阻碍了科研人员对药物虚拟筛选的深入研究。


针对这一难题，北鲲云创始人冯建新在公司成立之初就曾表示，北鲲云超算平台是专注于为高算力需求的企业和科研人员提供灵活、高效的算力产品及服务，帮助客户提升业务运行效率并有效降低成本。北鲲云超算平台，通过接入主流公有云资源，并在全球拥有25个地域节点，超过10万台服务器，单集群节点可提供10，000核时算力，算力资源丰富，可随时开启高性能计算，作业排队时间趋近于0.


北鲲云作为一家技术型公司，不断提高云资源的优化和管理，让用户真正体验到云计算带来的优势。