beamnrc 在64位计算机中share library的编译问题

通过使用share library,beamnrc的模块可以被dosxyz直接引用，即可实现避免phase spacefile的剂量计算。这个功能需要事先在BEAM_XXX的目录下make library生成该加速器的share library,即egsnrc_mp/bin/xxxxx/libXXX.so文件，然后在dosxyznrc中引用9号源即可。

但是最近在一台64位cluster上尝试的时候，发现报错： 类似

usr/lib64/gcc/x86_64-suse-linux/4.6/../../../../x86_64-suse-linux/bin/ld: /home/whl/HEN_HOUSE/lib/x86_64-unknown-linux-gnu-gfortran/egs_c_utils.o: relocation R_X86_64_32 against `fl_write' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC
/home/whl/HEN_HOUSE/lib/x86_64-unknown-linux-gnu-gfortran/egs_c_utils.o: could not read symbols: Bad value
collect2: ld returned 1 exit status
make: *** [/home/whl/egsnrc_mp/bin/x86_64-unknown-linux-gnu-gfortran/libBEAM_EX16MVp.so] Error 1

意思是需要使用-fPIC选项重新编译egs_c_utils.o

 

这个问题是由于在64的机器上安装egs的时候没有对gfortran和gcc的编译器增加-fPIC选项，或者即使增加了这个选项，也没有使用这个选项编译egs_c_utils.c和load_beam.c造成的。

 

 

解决：

（1）在安装egs的时候，需要对gfortran和gcc的编译器增加-fPIC选项

（2）如果安装的时候忘记增加了，也可以在安装之后，通过修改HEN_HOUSE/specs/x86_64_xxxxx.conf中的gfortran 和gcc选项

（3）需要使用-fPIC 重新编译HEN_HOUSE/lib/x86_64xxxxxx目录下的egs_c_utils.c和beam_load.c即

gcc -c -shared -fPIC egs_c_utils.c

gcc -c -shared -fPIC load_beamlib.c

 

 

参考：

http://blog.csdn.net/jernymy/article/details/6903779

http://irs.inms.nrc.ca/software/egsnrc/documentation/pirs898/installation.html

http://irs.inms.nrc.ca/software/egsnrc/documentation/Changelog_EGSnrc_V4-2.3.0.html