linux下配置JAVA查看RCSB/PDB蛋白质三维图片

系统：FC6
浏览器：mozilla firefox
参考：

蛋白质结构数据库： RCSB/PDB     
我是从 下载的Linux RPM（自解压文件）
参考其说明：
一，安装
进入下载文件目录
1, # chmod a+x jre-1_5_0-linux-i586.bin
2, # ./jre-1_5_0-linux-i586.bin
3, 选择yes就把java装在了/usr/java 下
二，启用和配置

编辑当前用户的.bashrc，即：

$gedit ~/.bashrc

加入如下五行：

JAVA_HOME=/usr/local/jdk1.5.0_11
JAVA_BIN=/usr/local/jdk1.5.0_11/bin
PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin
CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar
export JAVA_HOME JAVA_BIN PATH CLASSPATH
改为你的相应路径和版本

三，配置浏览器插件
我用 firefox 浏览器，则为libjavaplugin_oji.so建一个链接到firefox 相对应的目录中的plugins 目录中，其它浏览器同理；

[root@localhost plugins]# cd /usr/lib/firefox-1.0.10/plugins/
# ln -s /usr/java/jre1.5.0_11/plugin/i386/ns7/libjavaplugin_oji.so .

经过以上配置，可以在firefox中查看蛋白质三维结构图了。
给几个图片吧：

1，King


2,jmol

3,webmol