本文主要包括个节点MPI环境的安装，各节点无密码SSH连接，NFS配置。
一、各节点MPI环境的安装
（可以参考两个文档：和）
准备工作：centos6.2_x64系统，mpich2-1.4.1p1.tar。
配置三个节点的MPI机群，三节点分别为：host1，host2，host3。其中host2为主控节点。
每个节点都添加相同的用户名，有利于SSH无密码访问，我这里使用zll。
各节点名字最好有规律一点，修改方法有两种：
1.用vi打开/etc/sysconfig/network，命令式：vi /etc/sysconfig/network，然后看到里面有一个hostname = ***，把后面的修改为你想要的 host name即可，需重启。这是修改单节点的名字。
为了各节点间能够通过节点名顺利访问各节点，需要将各节点的/etc/hosts文件加入各节点的IP和hostname。如下：
准备好，开始安装。
1.解压文件。
其中mpi是安装mpi环境的目录。
2.配置MPI
进入解压后的文件夹，执行配置命令，其中prefix后面跟的是安装目录，这个用户可以自己选择。最新版本mpich2的进程管理默 认使用hydra，而不是mpd。如果想使用mpd，添加with-pm=mpd选择mpd。
3.编译安装MPI
4.修改环境变量
修改用户主文件夹(添加用户zll后，会主动在/home下创建用户主文件夹/home/zll下的.bash_profile文件，在PATH变量后面 添加自己的MPI路径，例如我把MPI安装在我的zll用户主文件夹mpi路径下，在PATH最后添加“：/home/zll/mpi/bin"。如下图
保存退出，并执行以下命令：source .bash_profile
测试环境变量设置
如果显示正确就是安装完成了。
5.创建文件.mpd.conf
进入用户主文件夹/home/zll（或者$HOME），
#创建文件
#设置权限
在.mpd.conf中添加一行：MPD_SECRETWORD=zll，其中zll可以随意起，但是三个节点要一致。这主要是使用mpd命令必须加入的，为了机器件的通信，如下图：
6.修改mpd.hosts文件
在主文件夹编辑mpd.hosts,写入三个节点的hostname，如下图
7.关闭防火墙
以root账户登录系统，执行service iptables stop关闭防火墙。
8.然后运行一下命令
其中第一条命令是启动一个mpd，
mpdtrace -l 查看mpd的主机名和端口号
mpdallexit是退出命令。
如果正常表示没有发生错误。（注意rhel6.2下面，执行程序前要执行mpdboot启用一组mpd进程，个数和节点个数一样：mpdboot -n 3 -f mpd.hosts,不然出错).
9.在其他节点上面执行以上步骤（可以不执行8）.
10.测试
在主控节点上面执行以下命令：
在其他节点执行
mpd -h {主控节点ip} -p {主控节点显示的端口号} &
在主节点执行mpdtrace -l，可以显示当前ring中的主机。如果顺利，各节点同MPI成功互联了。
二、无密码SSH
1.主控节点
在主控节点的主文件目录下，执行如下命令
一路回车，不输入其他东西。这时目录下会生成一个.ssh（注意不要自己建立.ssh这个目录，否则出问题）的目录，里面会生成id_rsa和id_ras.pub两个文件，进去.ssh执行
2.其他节点
然后在其他节点的主文件目录下执行以下命令
生成.ssh文件夹，不要自己创建.ssh文件夹。
3.复制文件
将主控节点的id_ras.pub,authorized_keys文件拷贝到其他节点的.ssh目录下。
4.测试
如果没有问题，现在可以实现主控节点到其他节点无密码ssh了，执行
ssh host1和ssh host3（host2和host3是其他两个节点）
第一次要输入”yes“，回车，注意不要直接回车。之后连接就直接可以连接了。
5.注意问题
使用rsa不是dsa，每个节点的.ssh目录要使用命令ssh-keygen -t rsa生成，不要自己建。
首次连接输入yes，回车，不要直接回车。
如果不成最好重启一下重试一次。（在rhel6.2上面我就是第一次没有成功，第二次成功了）。
三、NFS配置
三台机子是共享主控节点上主文件目录下的cluster文件夹，其中host2是nfs服务器，下面1-4在host2上面做。记得最好以root权限关闭防火墙或者在防火墙里面添加规则。
1.配置文件/etc/exports
配置文件/etc/exports，格式为：共享目录 可mount主机IP(参数1，参数2，……)
设置cluster的访问权限为777.
执行exportfs -r命令。
2.修改/etc/sysconfig/nfs
如果不修改后面会出mount.nfs: access denied by server while mounting 10.4.14.211:/home/zll/cluster。
在文件/etc/sysconfig/nfs添加一行：RPCNFSDARGS="--no-nfs-version 4".
网上好多解决方法，都不行，最后发现是nfs4的问题，就是nfs版本4有问题，禁止掉就行。
3.开启相关服务
启动以上命令的时候最好使用超级用户权限，否则有时候nfs服务打不开。
注意centos6.2及其以上版本将portmap更换成了rpcbind。
4.设置nfs开机自动启动
5.nfs客户端
开启nfs服务：sudo service nfs start
开机启动nfs服务：sudo chkconfig nfs on
可以查看可挂载的目录：showmount -e 10.4.14.211.
挂载：mount -t nfs 10.4.14.211:/home/zll/cluster /home/zll/cluster
开机自动挂载：在文件/etc/fstab最后一行添加：hostname（或者server ip）：/directory 本机挂载目录 nfs defaults 0 0
例如：host2：/home/zll/cluster /home/zll/cluster nfs defaults 0 0
（如果有问题，可以重启nfs服务器的nfs一下：sudo service nfs restart).
6.测试
可以在server端的cluster里面创建一个文件，然后在其他节点的挂载目录下看看有没有该文件，如果有表示成功。
以上都是经过本人亲自测试过，并且成功的。
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