砂島生態保護區面積約3公頃，長290公尺，寬100公尺，縱深約45公尺，坡度大約為10度左右,砂島貝殼展示中心 ，呈西北柲献呦颉Ｉ皪u生態保護區範圍南北兩側包含局部的裙礁地形，杺裙?放c海灘間則為小範圍馬鞍藤、無根藤、林投、白水木、草海桐、黃槿等植群構成的海岸植被社會，為墾丁國家公園中面積最小的生態保護區。
砂島生態保護區因緊臨台26號省道，植物群落受到公路的限制，局限於沙灘上，立地基倬鶠樯汉魉樾肌⒇悮に樾肌⒂锌紫x等所形成的沙地，可概分為砂地草本植物帶及臨海灌木植物帶。
砂地草本植物帶以馬鞍藤為優勢種，常大面積成片生長，伴生的植物有無根藤、濱豇豆、雙花蟛蜞菊等。由於砂地保水力低，且富含鹽分，加上強列海風吹襲，不僅造成乾旱環境,，且沙丘常因季節變換而移動，因此本區植物特性通常為宿根性，且伏地蔓生多分枝，每節均能產生不定根，以增進吸水功能及固定作用，而葉片則多肉偌氨砻嫦炠以儲存水分及防止水分蒸散散。
灌木植物帶以林投為優勢種，密生成一天然防風牆，伴生的植物有臭娘子、黃槿、土沉香、草海桐、白水木等，另有一些爬藤植物攀爬灌叢上,，如大萼旋花、雞屎藤等。本植物帶植物特徵為葉厚、革倩蚬饣?写獭Ａ硗獗緟^尚可見到一些木麻黃散佈其中，應為早其林政單位造林所遺留的樹種。