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java开发工程师,专注于内核源码,算法,数据结构。 qq:630501400

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分类: C/C++

2013-01-22 16:47:04

LCS问题

前几天被问到了LCS(最长公共子序列)问题,不会,正好学习一下。

LCS是求两个字符串,最长的公共部分,中间可以间隔其他的元素。例如,字符串s1=''mzjawxu'',s2=''xmjyauz'',仔细分析下,大体可以看出最长公共子序列是''mjau'',我们需要一套科学严格的方法来求解。这个问题是DP问题(动态规划问题)。动态规划问题:就是当前问题的求解依赖于上一个子问题,上一个子问题又依赖于前一个子问题,子问题无限递归。

按照算法导论上面的描述,对一个两个字符串XY,和它们的最长公共子序列Z,有如下的性质:

  1. 如果Zk=Xi=Yj,那么Zk-1是字符串Xi-1Yj-1的最长公共子序列。

    对一个最长公共子序列,这个序列中的字符串,每个元素在X,Y中肯定有相等的元素,这样才叫公共序列,那么如果Zk-1是字符串Xi-1Yj-1的最长公共子序列,而且Zk=Xi=YjZkXY中都有公共的元素,那么序列Z肯定是XY的最长公共子序列。

  2. 如果Xi!=Yj,那么Xi!=Zk,就表明了ZXi-1Yj的最长公共子序列。

    说明一下,这里YjZk的关系不确定,可能YjZk相等,也可能不相等。在Xi=Yj的前提下,假设Xi=Zk,同时ZXi-1Yj的最长公共子序列,这时,Xi=Zk,证明了在Xi-1之外,又找到了公共的子序列。所以Z应该是Xi,Yj的最长子序列,这与假设矛盾。

  3. 如果Xi!=Yj,那么Yi!=Zk,就表明了ZXiYj-1的最长公共子序列。

从上面的3条性质可以看出这两个规律:

  1. 如果Xi=Yj,那么这个最长公共子序列就应该是Xi-1,Yj-1的最长子序列然后在加上Xi。很明显在Xi-1Yj-1之外有找到了相同的公共元素,这个最长公共子序列应该在包括这个公共元素。
  2. 如果Xi!=Yj,可以想到XY的公共子序列 中,可能包括Xi,也可能包括Yj,但是这两个不可能同时出现,可能包括Xi的,不包括Yj的应该是XiYj-1的公共子序列,包括Yj的不包括Xi的,应该是Xi-1Yj的公共子序列,因为要求最长公共子序列,所以当Xi!=Yj的时候,最长公共子序列应该取,XiYj-1Xi-1Yj的公共子序列的最大值。

递推公式


                                      


     从上面的公式可以看出,LCS问题,求XY的最长公共子序列转化为Xi-1,Yj-1的子问题了,这样就是动态规划问题。可以看出这个问题的复杂度是Oi*j)。这个递归问题可以用二维数组解决。例子:X=''mzjawxu'',Y=''xmjyauz'',求它的最长公共子序列。

                                     

     上面的二维数组,黑色箭头代表找到了一个相同公共元素,这个元素应该在公共子序列中,这个元素和前面元素的最长子序列的并集,组成整个最长的子序列。每个元素的值表示每个字符串之间的最长公共子序列的长度,假设当前元素的位置(Xi,Yj,如果横坐标和纵坐标的字符相等,那么它的值等于(Xi-1,Yj-1)+1,如果横坐标和纵坐标的字符不相等,那么它的值等于max((Xi-1,Yj),(Xi,Yj-1)),这个二维数组完全映射了上面的那个递推公式。把所有子字符串的匹配的可能全部展示出来,从XY的字符串的最开始,递归后面的字符串。最后得到这个二维数组,数字最大的就是最长子序列的长度。

程序:

  1 #include 
  2 
  3 int data[8][8]={0};                 //初始化为全是0
  4 char *s1="mzjawxu";
  5 char *s2="xmjyauz";
  6 void print(int i,int j);
  7 int main(){
  8    int i=1,j=1;
  9    for(i=1;i<8;i++){
 10      for(j=1;j<8;j++){
 11         if(*(s1+i-1)==*(s2+j-1)){     //如果两个元素相同,那么这个元素的值等于对角的元素的值加一
 12            data[i][j]=data[i-1][j-1]+1;
 13         }else{                        //如果两个元素不同,取左侧元素和上方元素的最大值,这个值也就是Xi-1,Yj和Xi,Yj-1公共字串的最大长度
 14            data[i][j]=data[i][j-1]>data[i-1][j]?data[i][j-1]:data[i-1][j];
 15         }
 16 
 17      }
 18    }
 19    print(i,j);
 20 }
 21 
                            //递归打印最大公共子序列
 22 void print(int i,int j){
 23   if(i==0||j==0)
 24       return;
 25   if(*(s1+i-1)==*(s2+j-1)){
 26     print(i-1,j-1);
 27     printf("%c",*(s1+i-1));
 28   }else if(data[i][j-1]>data[i-1][j]){
 29     print(i,j-1);
 30   }else{
 31     print(i-1,j);
 32   }
 33 }

运算结果mjau

     


总结:

       解决LCS问题的关键在于理解那两个情况的递推公式,把问题转化为子问题,递归到最后,子问题最终会一个很简单的容易解答的问题,那么顺着最开始的子问题往回推倒父问,一步一步就得到整个问题的答案。

参考:

1.



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