选磷厂中的磨矿是和或水力旋流器成闭路进行的。磨矿可在一段或几段中进行。磨矿的段数等于矿浆顺旋通过的数，磨矿通常采用一段或两段。磨矿的段教和流程，由矿石特性、产品最终粒度和选矿生产能力来决定。硅质磷灰石矿大部都是中等硬度，磷灰石浸染粒度又比较粗，因此，都采用一段磨矿。当胶磷矿要求产品粒度细和选矿厂生产率大时，采用段数较多。相反，采用段数较少，常用流程如下。
流程是带检查分级的一段闭路流程。这种流程最简单，在选磷厂中应用较广泛。其优点是检查分级可控制磨矿产品的粒度，保证合乎下一步选别要求，增加单位时间内通过球的矿石数量，缩短矿石通过球磨机时间，减少了过粉碎，提高磨矿效率。流程是带预先分级一段闭路流程。这种流程只有在原矿中粒度较细，含合格产品在百分之十五以上时才应用。
目前低品位磷矿初期开采出的矿石大部分是地表风化矿，一般含泥量较多，如果在磨矿前用筛分控制粒度，避免合格粒度进入球磨机再磨，减少过粉碎现象。流程是带有控制分级一段闭路流程，这种流程适合于要得出粒度很细的溢流，并且要求溢流中不夹杂粗粒。