分类： 网络与安全
2011-05-12 16:48:15
深圳华大基因研究院以其基因的测序能力及基因组分析能力处于世界领先地位，自1999成立后，先后完成了国际人类基因组计划“中国部分”（1%）、国际人类单体型图计划（10%）、水稻基因组计划、家蚕基因组计划、家鸡基因组计划、抗SARS研究、炎黄一号等多项具有国际先进水平的科研工作。高性能计算集群（HPCC）是基因研究工作的重要工具，基因的测序、数据处理、比对分析和结果提取等，都要在HPCC上进行。
“基因研究可以比喻为破译生命的终极密码，而HPCC则是这个密码的破译机。”华大基因高性能计算主任方林介绍说，“这个破译机的计算能力必须要足够强大，否则根本无法支持基因研究工作的开展。以人的基因为例，如果把人的基因组都转化为数据并放在文件里，这个文件的大小约为3G，如果把与人的基因有关的辅助数据放在另外一个文件里，这个文件的大小要高达30个T。可以想象，如果把这两个文件的数据都放在计算机里进行比对和测序，将是何种的计算规模。”
因而，华大基因在升级其高性能计算平台时，非常关注性能，而且必须要通过华大基因的实际检测。最终，华大基因选择了基于戴尔M605刀片服务器的高性能计算平台。戴尔为客户提供了68片M605刀片服务器和5个M1000e刀片服务器机箱。方林主任表示：“在大量引入戴尔M605服务器后，我们的计算能力大概提升了两倍。这有力地推动了研究项目的开展，包括熊猫基因序列研究、中丹合作的糖尿病基因研究，中美英三国合作的千人基因组研究和人体肠道元基因组研究等在内的多个重大项目的进程，都有了不同幅度的加快，很多项目都将早出成果、多出成果。”
“如今华大基因的HPCC平台每天要产出大概10个T左右的数据，超过了很多大型企业一年的业务数据量。在如此繁重的计算任务面前，基于戴尔M605刀片服务器的HPCC平台运行得非常高效和稳定，没有出现任何故障。”方林主任如是说。
一直以来，戴尔致力于推动高性能计算的标准化和简便化，让更多各行各业的客户能够更加容易地使用高性能计算。高性能计算机的应用范围也变得更加广泛，正从传统的科学计算领域拓展到很多新兴的领域，如影视制作和动画渲染等。北京信息职业技术学院和常州广播电视台就是其中的典型代表。他们都选择了基于戴尔刀片服务器来打造其“动画渲染集群系统”。
3D数字影像特效制作和渲染工作的特点要求整个系统不仅计算能力要高，而且运行状态要稳。由于3D数字影像制作涉及到大量的色彩、色质、形态的处理，这就需要多CPU、多核，以多线程和进程的方式工作才能够满足三维影像渲染的需要。另外，由于渲染工作往往持续1天甚至10多天的时间，渲染工作任务对设备的连续工作能力需求极高，这就要求硬件设备稳定性要高。
北京信息职业技术学院引入了以112片戴尔PE M610刀片服务器，2台戴尔PE R710机架式服务器、1套第三方的光纤SAN存储阵列为核心，包括软件和服务的戴尔高性能计算解决方案。负责该系统建设的胡永先生介绍说：“以往我们渲染一个高清标准的1000帧动画，往往需要几周的时间，而且还得夜以继日。现在我们只需要1个多小时就可以完成相同的渲染任务，这对于我们来说是一个质的飞跃”。
常州广播电视台则建设完成了一套由40片戴尔PowerEdge™M610刀片服务器和1套DELL︱EMC CX4-240光纤磁盘阵列组成的“动画渲染集群”系统，将客户动画制作的总体效率提升了50%以上。
对于戴尔的高性能计算解决方案，客户除了高度认可其高性、稳定外，还充分赞扬了戴尔的服务和系统的环保和节能。
- 常州广播电视台客户技术部相关负责人说：“戴尔的服务十分到位，不仅为我们提供了较为全面的解决方案，而且在系统的部署过程中为我们完成了服务器上架安装、设备加电调试、操作系统安装等多项部署工作，帮助我们节省了90%的精力和时间。” 北京信息职业技术学院的胡永更是说到：“戴尔能够提供‘一站式’和‘端到端’的支持与服务，简化了我们对渲染集群系统的建设、管理和维护工作，让我们不必为复杂的系统浪费过多的时间和精力。”
- 华大基因的方林主任介绍说：“由于设备众多，且基本上是全天24小时运转，因此我们的电力消耗比较大，一个月的电费估计有10万元人民币。而采用M605后，我们每月预计能够节省2万元的电费。” 常州广播电视台客户技术部相关负责人说：“戴尔将我们的机房空间利用率提升了50%，单位空间能耗降低了23%，单位空间的计算能力提升了30%。”
根据IDC最新报告表明，目前HPCC的市场规模约为100亿美元，约占总服务器市场的20%。而IDC预测到2012年，该市场规模将增长至156亿美元，所销售的CPU中有25%将应用于HPCC环境。
戴尔在高性能计算领域拥有二十多年的研发经验，与业界领先的HPCC公司建立了合作关系，具备了真正的运营与服务的最佳实践和经验。自1999年起，戴尔一直走在开放、基于业界标准的HPCC运动的最前沿。这一运动最先起源于康奈尔高级计算中心The Cornell Center for Advanced Computing的64节点集群。如今，戴尔公司平均每天向多个行业的客户提供一个HPCC集群，通过高性能计算解决方案，帮助客户快速订购、实施及部署系统，从而大幅提高工作效率、降低成本、实现业务突破、创造更大的价值。
