由于两个MySQL进程需要不同的配置文件，且win98下，MySQL只将%windir%/my.ini作为配置文件，因此本人未能在win98下实现两个MySQL共存。以下所有操作本人均是在WInXP下进行，未验证其他系统。不过估计在 win2000， win2003下均可行。
1. 安装第一个MySQL，并将mysql作为系统进程启动。（本人安装目录为 d:/mysql）
2. copy d:/mysql 为 d:/mysql2。
3. 进入mysql2 目录， 修改其中的 my.ini， mysql_serviceuninstall.bat， mysql_servicestop.bat， mysql_servicestart.bat， mysql_serviceinstall.bat 四个文件。 具体为:
3.1 my.ini 修改
port=3306 改成 port=3307 。 一共有两处。我们让第二个MySQL监听3307端口
basedir=\"d:/MySQL\" 改成 basedir=\"d:/MySQL2\"
basedir=\"d:/MySQL/data\" 改成 basedir=\"d:/MySQL/data\"
3.2 mysql_servicestart.bat 修改
bin\\mysqld-nt --install mysql --defaults-file=d:\\MySQL\\my.ini 改成 bin\\mysqld-nt --install mysql2 --defaults-file=d:\\MySQL2\\my.ini
net start MySQL 改成 net start MySQL2
3.3 mysql_servicestart.bat 修改
net start MySQL 改成 net start MySQL2
3.4 mysql_servicestop.bat 修改
net stop MySQL 改成 net stop MySQL2
3.5 mysql_serviceuninstall.bat 修改
net stop mysql 改成 net stop mysql2；
bin\\mysqld-nt --remove mysql 改成 bin\\mysqld-nt --remove mysql2
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OK。 我们马上就可以达到目的了。 运行MySQL2目录下的mysql_servicestart.bat文件（只要双击就可以了)。 现在，修改你的phpMyAdmin 下的config.ini.php 吧。(把localhost改成localhost:3307) 只要添加一个新的server 就可以了。 不过，这个新添加的server，一定要指定端口啊（3307）。否则，你会连不上第二个MySQL的。
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