这个文章比较好：
http://www.cnblogs.com/yuphone/archive/2010/01/28/1658194.html/////////////////////////////////////////////////////
我以EPCS4为例说明自己是如何做的
（1）受先打开quartus 2软件，（这是废话）
（2）任意打开一个工程。(又是废话)
（3）打开file菜单选择convert programming file 点击
（4）在programming file type 选项中选择JTAG INDIRECTFILE(JIC)
（5）在configuration device选项中选择你使用的EPCS器件，我选择EPCS4
(6)FILEname你可以修改，也可以不动，根据个人爱好。
（7）在input file选项中单击FLASH LOADER会出现add device选项，选择你要使用的器件。
（8）单击SOF data同样添加你需要固化到EPCS4中的程序，文件类型为SOF,然后单击你刚添加了的文件，再要点击下面的properties在空格内勾选。
(9)如果没有HEX文件就单击它，就不要要他了。
(10)然后单击Generat.
(11)最后在quartus里下载的时候，选择.jic文件即可。
EPCS的擦写是有一定次数的（参见相关datasheet）。
http://www.cnblogs.com/hclmcu/archive/2010/07/12/1775924.html
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