Bioperl wiki原文链接如下:
我的乖乖,太棒了!有了这家伙,烦人的模块更新应该就可以解决了。
操作如下:
1,首先安装工具git,不多表(./configure,make,make install)
2,从GitHub下载bioperl-live
创建git存放的文件夹,切换,然后
$ git clone git://github.com/bioperl/bioperl-live.git
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运行完成后会在新建文件夹 bioperl-live,ok!bioperl-live 安装完毕,不过还有一个步骤,这个步骤告诉perl到那里寻找我们安装的模块的位置。
$ export PERL5LIB="$HOME/git/bioperl-live:$PERL5LIB"
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运行
$ perl -MBio::Perl -le 'print Bio::Perl->VERSION;' |
打印如下:
未安装是显示的是
1.006001
大功告成!
ps:我用的是zsh,其他的具体的操作见bioperl wiki 链接。
ps2:要想一直使用live版的bioperl 可将上面的环境变量设置语句放置在对应的shell控制文件中,比如我的zsh控制文件安是~.zshrc(感觉自己太唐僧了,嘿嘿)。
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