Chinaunix首页 | 论坛 | 博客
  • 博客访问: 29247
  • 博文数量: 15
  • 博客积分: 650
  • 博客等级: 上士
  • 技术积分: 160
  • 用 户 组: 普通用户
  • 注册时间: 2009-05-31 22:01
文章分类

全部博文(15)

文章存档

2011年(2)

2010年(6)

2009年(7)

我的朋友

分类:

2011-01-05 15:57:46

Bioperl wiki原文链接如下:


我的乖乖,太棒了!

有了这家伙,烦人的模块更新应该就可以解决了。
操作如下:
1,首先安装工具git,不多表(./configure,make,make install)
2,从GitHub下载bioperl-live
创建git存放的文件夹,切换,然后

$ git clone git://github.com/bioperl/bioperl-live.git


运行完成后会在新建文件夹 bioperl-live,ok!bioperl-live 安装完毕,不过还有一个步骤,这个步骤告诉perl到那里寻找我们安装的模块的位置。

$ export PERL5LIB="$HOME/git/bioperl-live:$PERL5LIB"

运行

$ perl -MBio::Perl -le 'print Bio::Perl->VERSION;'

打印如下:

1.0069


未安装是显示的是
1.006001

大功告成!
ps:我用的是zsh,其他的具体的操作见bioperl wiki 链接。
ps2:要想一直使用live版的bioperl 可将上面的环境变量设置语句放置在对应的shell控制文件中,比如我的zsh控制文件安是~.zshrc(感觉自己太唐僧了,嘿嘿)。
阅读(576) | 评论(0) | 转发(0) |
给主人留下些什么吧!~~