试试calibre drv
在terminal中输入calibredrv -shell，然后输入下面的命令
layout filemerge -in dummy.gds -in original.gds -out final.gds -createtop TOP
-in指定要merge的gds文件
-out指定merge后的gds文件
-createtop指定merge后gds中的顶层单元
层次化和平的都可以用。如果是层次化的，有一个参数-mode用来设置对同名单元的处理。
-mode有四个值，如下：
forcerename 这个是default，所有单元都会重命名，添加后缀_WBx
rename 同名单元重命名
overwrite 第二个gds文件中的单元会覆盖第一个gds文件中的同名单元
append 两个文件中的同名单元中的版图元素会合并在同一个单元中
我记得是这样子的，供参考，准确的描述你可以去查reference。
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