..微笑着看着杯中的花茶一片片撑开.. ..透明的花瓣里水破开的声音很轻微..
发布时间：2016-07-12 16:53:24
PAML 手册 By 斑斑 5 basemlg baseml相同的控制文件runmode= 0和basemlg可用的模型有F81，F84和gamma分布。变量given_rho，nhomo在这里无效。因为迭代过程中计算S.E.s总是会输出，因此 basemlg需要密集计算，因此对于数据分析推荐gamma模型。如果你选择使用baseml，然后在运行baseml将初始.........【阅读全文】
发布时间：2016-07-04 20:04:27
本文翻译自CAP3自带的说明文档，由于水平有限，文中尚有存在疑义的地方，阅读时请参照原文进行解读。 TransDecoder识别转录本序列中候选的编码区域，诸如那些将RNA-Seq数据用Trinity从头组装或者使用Tophat和Cufflinks将RNA-Seq比对到基因组中构建的转录本。TransDecoder 基于以下标准识别可能的编码.........【阅读全文】
发布时间：2016-06-30 17:53:29
本文翻译自CAP3自带的说明文档，由于水平有限，文中尚有存在疑义的地方，阅读时请参照原文进行解读。 若使用CAP3请引用文章:Huang, X. and Madan, A. (1999)CAP3: A DNA Sequence Assembly Program,Genome Research, 9: 868-877. 简介我们在以下几方面对CAP序列组装程.........【阅读全文】
发布时间：2013-08-16 11:32:03
没想到这么快再次接触芯片数据，这次的芯片类型是affymetrix的U133A芯片。其实是已经公布的数据了，只是拿来再看看。这次只是先简单看下，所以并不是从原始数据开始分析。数据是06年的老数据。在EBI的ArrayExpress上下的。如下： 这次只说下如何将探针ID转换为基因的SYMBOL。当然相同的方法也可以.........【阅读全文】
