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2012年(22)

2011年(153)

分类: C/C++

2011-08-09 11:18:55

通过把耗时长的函数用c语言实现,并编译成mex函数可以加快执行速度。Matlab本身是不带c语言的编译器的,所以 要求你的机器上已经安装有VC,BC或Watcom C中的一种。如果你在安装Matlab时已经设置过编译器,那么现在你应该就可以使用mex命令来编 译c语言的程序了。如果当时没有选,就在Matlab里键入mex -setup,下面只要根据提示一步步设置就可以了。需要注意的是,较低版本的在设置 编译器路径时,只能使用路径名称的8字符形式。比如我用的VC装在路径C:\PROGRAM FILES\DEVSTUDIO下,那在设置路径时就要写 成:“C:\PROGRA~1”这样设置完之后,mex就可以执行了。为了测试你的路径设置正确与否,把下面的程序存为hello.c。
/*hello.c*/


#include "mex.h" 
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[]) 
{ mexPrintf("hello,world!\n"); 

假设你把hello.c放在了C:\TEST\下,在Matlab里用CD C:\TEST\ 将当前目录改为C:\ TEST\(注意,仅将C:\TEST\加入搜索路径是没有用的)。现在敲:
mex hello.c 
如果一切顺利,编译应该在出现编译器提示信息后正常退出。如果你已将C:\TEST\加
入了搜索路径,现在键入hello,程序会在屏幕上打出一行:
hello,world! 
看看C\TEST\目录下,你会发现多了一个文件:HELLO.DLL。这样,第一个mex函数就算完成了。分析hello.c,可以看到程序的结构是十分简单的,整个程序由一个接口子过程 mexFunction构成。
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[]) 
前面提到过,Matlab的mex函数有一定的接口规范,就是指这
nlhs:输出参数数目 
plhs:指向输出参数的指针 
nrhs:输入参数数目 
例如,使用
[a,b]=test(c,d,e)
调用mex函数test时,传给test的这四个参数分别是
      2,plhs,3,prhs
其中: 
prhs[0]=c 
prhs[1]=d 
prhs[2]=e 
当函数返回时,将会把你放在plhs[0],plhs[1]里的地址赋给a和b,达到返回数据的目的。  
细心的你也许已经注意到,prhs[i]和plhs[i]都是指向类型mxArray类型数据的指针。 这个类型是在mex.h中定义的,事实上,在Matlab里大多数数据都是以这种类型存在。当然还有其他的数据类型,可以参考Apiguide.pdf里的介绍。 
为了让大家能更直观地了解参数传递的过程,我们把hello.c改写一下,使它能根据输 
入参数的变化给出不同的屏幕输出:
//hello.c 2.0 
#include "mex.h" 
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[]) 
{
int i; 
i=mxGetScalar(prhs[0]); 
if(i==1) 
  mexPrintf("hello,world!\n"); 
else 
  mexPrintf("大家好!\n"); 
}
将这个程序编译通过后,执行hello(1),屏幕上会打出: 
          hello,world! 
而hello(0)将会得到: 
           大家好! 
现在,程序hello已经可以根据输入参数来给出相应的屏幕输出。在这个程序里,除了用到了屏幕输出函数mexPrintf(用法跟c里的printf函数几乎完全一样)外,还用到了一个函数:mxGetScalar,调用方式如下: 
   i=mxGetScalar(prhs[0]); 
"Scalar" 就是标量的意思。在Matlab里数据都是以数组的形式存在的,mxGetScalar的作用就是把通过prhs[0]传递进来的mxArray类型的指 针指向的数据(标量)赋给C程序里的变量。这个变量本来应该是double类型的,通过强制类型转换赋给了整形变量i。既然有标量,显然还应该有矢量,否 则矩阵就没法传了。看下面的程序: 
//hello.c 2.1 
#include "mex.h" 
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], 
int nrhs, const mxArray *prhs[]) 

int *i; 
i=mxGetPr(prhs[0]); 
if(i[0]==1) 
  mexPrintf("hello,world!\n"); 
else 
  mexPrintf("大家好!\n"); 
}  
这样,就通过mxGetPr函数从指向mxArray类型数据的prhs[0]获得了指向double类型的指针。
但是,还有个问题,如果输入的不是单个的数据,而是向量或矩阵,那该怎么处理呢 ?通过mxGetPr只能得到指向这个矩阵的指针,如果我们不知道这个矩阵的确切大小,就 
没法对它进行计算。 
为了解决这个问题,Matlab提供了两个函数mxGetM和mxGetN来获得传进来参数的行数 和列数。下面例程的功能很简单,就是获得输入的矩阵,把它在屏幕上显示出来: 
//show.c 1.0 
#include "mex.h" 
#include "mex.h" 
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[]) 

double *data; 
int M,N; 
int i,j; 
data=mxGetPr(prhs[0]); //获得指向矩阵的指针 
M=mxGetM(prhs[0]); //获得矩阵的行数 
N=mxGetN(prhs[0]); //获得矩阵的列数 
for(i=0;i
{   for(j=0;j
     mexPrintf("%4.3f  ",data[j*M+i]); 
     mexPrintf("\n"); 
  }

编译完成后,用下面的命令测试一下: 
  a=1:10; 
  b=[a;a+1]; 
  show(a) 
  show(b) 
需要注意的是,在Matlab里,矩阵第一行是从1开始的,而在C语言中,第一行的序数为零,Matlab里的矩阵元素b(i,j)在传递到C中的一维数组data后对应于data[j*M+i] 。因为C与matlab的存储方式不同!


输入数据是在函数调用之前已经在Matlab里申请了内存的,由于mex函数与Matlab共用同一个地址空间,因而在prhs[]里传递指针就可以达到参数传递的目的。但是,输出参数却需要在mex函数内申请到内存空间,才能将指针放在plhs[]中传递出去。由于返回指针类型必须是mxArray,所以 Matlab专门提供了一个函数:mxCreateDoubleMatrix来实现内存的申请,函数原型如下: 
   mxArray *mxCreateDoubleMatrix(int m, int n, mxComplexity ComplexFlag) 
   m:待申请矩阵的行数 
   n:待申请矩阵的列数 


为矩阵申请内存后,得到的是mxArray类型的指针,就可以放在plhs[]里传递回去了。但是对这个新矩阵的处理,却要在函数内完成,这时就需要用到前面介绍的mxGetPr。使用mxGetPr获得指向这个矩阵中数据区的指针(double类型)后,就可以对这个矩阵进行各种操作和运算了。下面的程序是在上面的show.c的基础上稍作改变得到的。 
//reverse.c 1.0 
#include "mex.h" 
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], 
    int nrhs, const mxArray *prhs[]) 

double *inData; 
double *outData; 
int M,N; 
int i,j; 
inData=mxGetPr(prhs[0]); 
M=mxGetM(prhs[0]); 
N=mxGetN(prhs[0]); 
plhs[0]=mxCreateDoubleMatrix(M,N,mxREAL); 
outData=mxGetPr(plhs[0]); 
for(i=0;i
  for(j=0;j
   outData[j*M+i]=inData[(N-1-j)*M+i]; 

当然,Matlab里使用到的并不是只有double类型这一种矩阵,还有字符串类型、稀疏矩阵、结构类型矩阵等等,并提供了相应的处理函数。本文用到编制mex程序中最经常遇到的一些函数,其余的详细情况清参考Apiref.pdf。


 
通过前面两部分的介绍,大家对参数的输入和输出方法应该有了基本的了解。具备了这些知识,就能够满足一般的编程需要了。但这些程序还有些小的缺陷,以前面介绍的为例,由于前面的例程中没有对输入、输出参数的数目及类型进行检查,导致程序的容错性很差,以下程序则容错性较好
#include "mex.h" 
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[],  int nrhs, const mxArray *prhs[]) 

double *inData; 
double *outData; 
int M,N; 
//异常处理 
//异常处理 
if(nrhs!=1) 
    mexErrMsgTxt("USAGE: b=reverse(a)\n"); 
  if(!mxIsDouble(prhs[0])) 
   mexErrMsgTxt("the Input Matrix must be double!\n"); 
   inData=mxGetPr(prhs[0]); 
   M=mxGetM(prhs[0]); 
   N=mxGetN(prhs[0]); 
   plhs[0]=mxCreateDoubleMatrix(M,N,mxREAL); 
   outData=mxGetPr(plhs[0]); 
   for(i=0;i
     for(j=0;j
     outData[j*M+i]=inData[(N-1-j)*M+i]; 
  } 
在上面的异常处理中,使用了两个新的函数:mexErrMsgTxt和mxIsDouble。MexErrMsgTxt在给出出错提示的同时退出当前程序的 运行。MxIsDouble则用于判断mxArray中的数据是否double类型。当然Matlab还提供了许多用于判断其他数据类型的函数,这里不加详述。 
需要说明的是,Matlab提供的API中,函数前缀有mex-和mx-两种。带mx-前缀的大多是对mxArray数据进行操作的函数,如 mxIsDouble,mxCreateDoubleMatrix等等。而带mx前缀的则大多是与Matlab环境进行交互的函数,mexPrintf,mxErrMsgTxt等等。了解了这一点,对在Apiref.pdf中查找所需的函数很有帮助。
至此为止,使用C编写mex函数的基本过程已经介绍完了。 

Matlab调用C语言函数

转载自frensel
如果我有一个用C语言写的函数,实现了一个功能,如一个简单的函数:

1
2
3
double add(double x, double y) {
return x + y;
}

现在我想要在Matlab中使用它,比如输入:
>> a = add(1.1, 2.2)
3.3000

要得出以上的结果,那应该怎样做呢?

解决方法之一是要通过使用MEX文件,MEX文件使得调用C函数和调用Matlab的内置函数一样方便。MEX文件是由原C代码加上MEX文件专用的接口函数后编译而成的。
可以这样理解,MEX文件实现了一种接口,它把在Matlab中调用函数时输入的自变量通过特定的接口调入了C函数,得出的结果再通过该接口调回Matlab。该特定接口的操作,包含在mexFunction这个函数中,由使用者具体设定。
所 以现在我们要写一个包含add和mexFunction的C文件,Matlab调用函数,把函数中的自变量(如上例中的1.1和2.2)传给 mexFunction的一个参数,mexFunction把该值传给add,把得出的结果传回给mexFunction的另一个参数,Matlab通过 该参数来给出在Matlab语句中调用函数时的输出值(如上例中的a)。
比如该C文件已写好,名为add.c。那么在Matlab中,输入:
>> mex add.c
就 能把add.c编译为MEX文件(编译器的设置使用指令mex -setup),在Windows中,MEX文件类型为mexw32,即现在我们得出add.mexw32文件。现在,我们就可以像调用M函数那样调用 MEX文件,如上面说到的例子。所以,通过MEX文件,使用C函数就和使用M函数是一样的了。
我们现在来说mexFunction怎样写。
mexFunction的定义为:

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void mexFunction(
int nlhs,
mxArray *plhs[],
int nrhs,
const mxArray *prhs[]) {
/*....................................*/
}

可以看到,mexFunction是没返回值的,它不是通过返回值把结果传回Matlab的,而是通过对参数plhs的赋值。mexFunction的四个参数皆是说明Matlab调用MEX文件时的具体信息,如这样调用函数时:
>> b = 1.1; c = 2.2;
>> a = add(b, c)
mexFunction四个参数的意思为:
nlhs = 1,说明调用语句左手面(lhs-left hand side)有一个变量,即a。
nrhs = 2,说明调用语句右手面(rhs-right hand side)有两个自变量,即b和c。
plhs是一个数组,其内容为指针,该指针指向数据类型mxArray。因为现在左手面只有一个变量,即该数组只有一个指针,plhs[0]指向的结果会赋值给a。
prhs和plhs类似,因为右手面有两个自变量,即该数组有两个指针,prhs[0]指向了b,prhs[1]指向了c。要注意prhs是const的指针数组,即不能改变其指向内容。
因 为Matlab最基本的单元为array,无论是什么类型也好,如有double array、 cell array、 struct array……所以a,b,c都是array,b = 1.1便是一个1×1的double array。而在C语言中,Matlab的array使用mxArray类型来表示。所以就不难明白为什么plhs和prhs都是指向mxArray类型 的指针数组。
完整的add.c如下:

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// add.c
#include "mex.h" // 使用MEX文件必须包含的头文件
// 执行具体工作的C函数
double add(double x, double y) {
return x + y;
}
// MEX文件接口函数
void mexFunction(
int nlhs,
mxArray *plhs[],
int nrhs,
const mxArray *prhs[]) {
double *a;
double b, c;
plhs[0] = mxCreateDoubleMatrix(1, 1, mxREAL);
= mxGetPr(plhs[0]);
= *(mxGetPr(prhs[0]));
= *(mxGetPr(prhs[1]));
*= add(b, c);
}

mexFunction的内容是什么意思呢?我们知道,如果这样调用函数时:
>> output = add(1.1, 2.2);
在 未涉及具体的计算时,output的值是未知的,是未赋值的。所以在具体的程序中,我们建立一个1×1的实double矩阵(使用 mxCreateDoubleMatrix函数,其返回指向刚建立的mxArray的指针),然后令plhs[0]指向它。接着令指针a指向 plhs[0]所指向的mxArray的第一个元素(使用mxGetPr函数,返回指向mxArray的首元素的指针)。同样地,我们把prhs[0]和 prhs[1]所指向的元素(即1.1和2.2)取出来赋给b和c。于是我们可以把b和c作自变量传给函数add,得出给果赋给指针a所指向的 mxArray中的元素。因为a是指向plhs[0]所指向的mxArray的元素,所以最后作输出时,plhs[0]所指向的mxArray赋值给 output,则output便是已计算好的结果了。
上面说的一大堆指向这指向那,什么mxArray,初学者肯定都会被弄到头晕眼花了。很抱歉,要搞清楚这些乱糟糟的关系,只有多看多练。
实际上mexFunction是没有这么简单的,我们要对用户的输入自变量的个数和类型进行测试,以确保
输入正确。如在add函数的例子中,用户输入char array便是一种错误了。
从 上面的讲述中我们总结出,MEX文件实现了一种接口,把C语言中的计算结果适当地返回给Matlab罢了。当我们已经有用C编写的大型程序时,大可不必在 Matlab里重写,只写个接口,做成MEX文件就成了。另外,在Matlab程序中的部份计算瓶颈(如循环),可通过MEX文件用C语言实现,以提高计 算速度。

MATLAB调用C/C++函数的方法

    通过MATLAB将C/C++函数编译成MEX函数,在MATLAB中就可以调用了。

1,首先装编译器
Matlab里键入mex -setup,选择你要编译C++的编译器

2,写C++函数
函数的形式必须是
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[])
nlhs:输出参数个数
plhs:输出参数列表
nrhs:输入参数个数
prhs:输入参数列表
,不过函数名可以随便取的。注意:保存的文件名就是将来在MATLAB中调用的函数名,而不是这里的函数名。
下面给出一个例子,目的是想截取数组的部分元素组成新的数组
输入参数3个,目标数组,截取的行(向量),截取的列(向量)
输出参数2个,截取后数组,数组维数信息
在函数中展示了如何传入传出参数,以及如果从参数列表中取出每一个参数,MATLAB数据和C++数据的互相转换,还有一些输出函数等。
新建一个ResizeArray.cpp文件(ResizeArray将作为MATLAB调用的函数名),写入下面代码

#include "mex.h" 
//author: 汪帮主 2010.05.05
//MATLAB调用形式: [resizedArr, resizedDims] = ResizeArray(arr, selRows, sekCols)
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[]) 

    if (nrhs != 3)
    {
        mexErrMsgTxt("参数个数不正确!");
    }
    
    int rowNum = mxGetM(prhs[0]);
    int colNum = mxGetN(prhs[0]);
    double* pArr = (double*)mxGetPr(prhs[0]);
    //得到选择的行列信息
    //无论是行向量还是列向量均支持

    double* pSelRows = (double*)mxGetPr(prhs[1]);
    double* pSelCols = (double*)mxGetPr(prhs[2]);
    int selRowsRowNum = mxGetM(prhs[1]);
    int selRowsColNum = mxGetN(prhs[1]);
    if (selRowsRowNum!=1 && selRowsColNum!=1)
    {
        mexErrMsgTxt("行参数不正确!");
    }
    int selRowsNum = selRowsRowNum*selRowsColNum;
    
    
    int selColsRowNum = mxGetM(prhs[2]);
    int selColsColNum = mxGetN(prhs[2]);
    if (selColsRowNum!=1 && selColsColNum!=1)
    {
        mexErrMsgTxt("列参数不正确!");
    }
    int selColsNum = selColsRowNum*selColsColNum;
   
    plhs[1] = mxCreateDoubleMatrix(2, 1, mxREAL);
    double* resizedDims = (double*)mxGetPr(plhs[1]);
    resizedDims[0] = selRowsNum;
    resizedDims[1] = selColsNum;    
     
    plhs[0] = mxCreateDoubleMatrix(selRowsNum, selColsNum, mxREAL);
    double* pResizedArr =(double*)mxGetPr(plhs[0]);
    
    //这里因为MATLAB中数据得按列优先
    #define ARR(row,col) pArr[(col)*rowNum+row]
    #define RARR(row,col) pResizedArr[(col)*selRowsNum+row]
    for(int ri=0; ri    {
     for(int ci=0; ci     {
      RARR(ri,ci)=ARR((int)pSelRows[ri]-1,(int)pSelCols[ci]-1);
     }
    }
    
    mexPrintf("OK!\n"); 
}

3,编译C++函数为MEX函数
将ResizeArray.cpp放在MATLAB当前目录中,在MATLAB中输入mex ResizeArray.cpp,编译成功后将会生成ResizeArray.mexW32

4,调用函数
arr=[11:19;21:29;31:39;41:49;51:59;61:69];
selRows=[1 3];
selCols=[2:4 5 9];
[rarr,rdims]=ResizeArray(arr,rows,cols);
arr中数据:
11 12 13 14 15 16 17 18 19
21 22 23 24 25 26 27 28 29
31 32 33 34 35 36 37 38 39
41 42 43 44 45 46 47 48 49
51 52 53 54 55 56 57 58 59
61 62 63 64 65 66 67 68 69
rarr中数据:
12 13 14 15 19
32 33 34 35 39
rdims为:
2
5


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